discovery studio 2.5中文破解版

discovery studio 2.5是很著名的一款可以在个人电脑上进行全新的分子建模环境，专业的生命科学分子模拟软件，简称：DS。软件分为服务器和推广客户端模式，这种模式使得大家的科研职员可以最大程度最大限度的达成计算机资源共享，让大家的用户更好的进行科研工作。现在来讲，discovery studio 2.5是最好的生命科学范围的软件，海量的像是实验生物学家、结构生物学家、计算生物学家等专业的生物方面的研究职员都十分的推崇这款软件，尤其是专门为这方面科学家提供医用的蛋白质模拟、优化和药物设计工具等等，让大家的科研职员可以高效率的进行工作。discovery studio 2.5可以通过优质的图形、多年验证的技术与集成的环境，为大家的用户提供实验数据的保存、管理与专业水准的建模，叫你在模拟和科研过程中通过这一款软件即可完成所有任务。

discovery studio 2.5对于员工之间的交流也可以提供很好的帮忙，打造最新的步骤管理平台Pipeline Pilot的基础上的DS可以让科研职员的数据获得共享，使得交流也无需详细讲解，只须查询一下数据所有都可以明了。这款discovery studio 2.5是很好的科技方面的软件，不过还是建议用户用正版比较安全靠谱，假如仅学习，那样2.5版本更稳定更合适，需要的用户不要错过哦。

软件安装破解课程

1、下载完毕后将ISO镜像文件加载到驱动器上。需要软碟通。

2、然后进入光驱，运行“setup.exe”。

3、点击next，选择安装路径，软件有点大建议安装在其他盘，更改安装路径时应该注意，不要出现中文，不然会没办法辨别导致程序没办法用。

4、选择安装种类，当中这个是全部安装，大家选择这一个，假如用户有我们的需要，那样选择第三个自概念安装，第一个是基本功能安装。

5、选择交流工具Pipeline Pilot的安装地方。

6、下面就是一路next，直到安装完毕。

7、安装完成将来，不要勾选“Configure Licensing”。

8、然后打开开始菜单中的许可证管理工具。

9、点击“Install License”，将安装包中的许可文件“accelrys_25.lic”选进来，即可完成破解。

模块介绍

1、基本界面和显示模块

·Discovery Studio 2.5 Standalone

可视化界面，是借助Discovery Studio软件进行分子设计和模拟的基础，支持服务器-推广客户端安装在同一台机器上的运行模式。与Pipeline Pilot Server结合在一块，提供化学/生物学数据显示、模拟/剖析、构建三维分子、展示动态变化、三维作图及很多其它功能。

·Discovery Studio 2.5 Visualizer Client

是服务器-推广客户端运行模式中、推广客户端的可视化界面，用于访问和用服务器端的Discovery Studio软件。需要与服务器端配置的Pipeline Pilot Server协同工作，为用户提供独一无二的数据、工作步骤和计算资源共享。

2、蛋白质模拟模块

·DS MODELER

只须给出未知结构序列与另一个已知三维结构蛋白的比对，借助工业标准的迅速同源模建办法，便可自动并迅速产生优化的蛋白同源模型。对于靶标发现及蛋白家族功能结构剖析，MODELER是一个理想的解决方法。用MODELER还可以模拟蛋白突变，进行loop区模建及基于结构的比对并构建有配体结合的蛋白结构模型。结合Sequence Analysis模块，可以全自动完成抗体Loop区模建。结合Discovery Studio里模拟及以结构为基础的药物设计的功能模块，用MODELER还可以深入研究蛋白结构及功能的关系。

3、基于结构的药物发现和设计模块

·DS Flexible Docking

受体柔性对接工具（Induced-Fit对接工具），可以达成配体-受体双柔性对接，模拟配体与受体结合时的诱导-契合效应（induced-fit）。Flexible Docking模块先对蛋白活性口袋的侧链产生多个构象，然后将配体对接到受体的活性口袋当中，最后对得到的配体-受体复合物结构进行优化。Flexible Docking最大的优势在于准确，可以精细地研究配体-受体的相互用途信息，合适于用途机理研究。需要DS CHARMm, DS LibDock, DS Catalyst Conformation, DS Protein Refine模块支持。

·DS LigandFit

LigandFit模块可以便捷迅速地将小分子化合物对接到生物大分子的活性位点中，是一个迅速、灵活的分子对接程序，可以考虑配体结合取向、结合构象与形状匹配等多种原因。LigandFit在高通量虚拟筛选时可并行计算。同时具备设置interaction filter的功能。

·DS LigandScore

discovery studio 2.5使用经过验证的打分函数与特定的描述符，评价受体-配体间的相互用途。通过对LigandFit对接结果的剖析，可帮助用户确定结合模式方面可能存在的问题，区别正确或错误的结合构象，把不同结合构象的配体依次排序以供筛选或合成用。可自概念参数，可将所有设置保存并与其他用户共享。LigandScore在高通量的虚拟筛选时也可并行计算。

4、基于药效团的药物发现和设计模块

·DS Catalyst Conformation

多样、完全且迅速的构象模型生成工具，可以选择使用Polling或CAESAR算法生成构象，生成的构象用于产生药效团模型或进行数据库搜索。

·DS Catalyst Hypothesis

对一组化合物进行基于特质结构的比对并自动生成药效团模型的工具。这类特质结构包含亲疏水性基团、氢键给体/受体和正/负电荷基团等。产生药效团模型时假如提供具体的活性数据，可以产生3D-QSAR药效团并用之来预测新化合物的活性，假如在产生药效团的过程中考虑排除体积，从而引入受体占有空间位阻的信息，精修后得到的药效团模型可以提升预测能力；产生药效团模型时假如不提供具体的活性数据，可依据化合物和药效团叠合、匹配的状况对候选分子或三维数据库搜寻结果的活性进行定性的评价。

5、基于小分子的药物发现和设计模块

·DS QSAR

定量构效关系研究工具。discovery studio 2.5可以计算几百种与生物活性或ADME/T性质有关的描述符，包含分子拓扑描述符、分子指纹在内的一系列基本性质。还提供了多种统计工具，如Bayesian模型、多元线形回归、最小二乘法等，用于对各种复杂数据进行建模和数据挖掘。

·GFA Component

遗传算法建模组件，可通过DS QSAR或Pipeline Pilot调用。

·VAMP Descriptors Component/ DMol3 Descriptors Component

用半经验量子力学程序VAMP及DFT量子力学程序DMol3进行化合物性质描述符计算的组件。

6、分子力学和分子动力学计算模块

·DS CHARMm

借助这个工业标准的分子力学及动力学程序，研究多种分子（从小分子配体到多组分的复合物）的热力学及动力学特质。基于哈佛的CHARMM模拟引擎，CHARMm不断开发升级并增加最新的功能。另外，由于CHARMm也可在同一界面用于Discovery Studio里基于结构的药物设计模块中，因此比较容易进行蛋白、配体、蛋白和配体复合物的计算及剖析，也可以愈加灵活地借助CHARMm的编程功能，加快药物发现。基于CHARMm的对接算法CDOCKER用于柔性分子对接，在此基础上，借助CHARMm还可以进行考虑药效团限制的分子对接。同时通过熵的计算可以进一步提升MM-GBSA和MM-PBSA受体-配体结合自由能计算的准确性。CHARMm带有些stand-alone输入工具，可让用户在批处置模式下借助CHARMm力场及自动参数预测功能确定整个化合物库中化合物的力场种类。适合的力场，PME静电模型和溶剂化时添加对应离子的能力确保准确的核酸模拟研究。用户可以用CHARMm组件定制复杂的模拟步骤，也可以将该步骤与其它计算应用软件整理在一块用。

7、剖析模块

·DS Biopolymer

DS Biopolymer模块整理了Delphi功能，为用户提供操作容易易学而且好用的模型搭建与静电势剖析工具。DS Biopolymer可用于搭建和修饰蛋白质和小肽分子、将蛋白质复合物分成不一样的组分、迅速产生肽类或蛋白质分子的性质剖析报告、计算大分子和小分子的静电势分布和溶剂化能与蛋白氨基酸残基pK值的计算等方面。DS Biopolymer产生的小分子与生物大分子模型可以在Discovery Studio其他模块中进行进一步的剖析。

·DS Analysis

结果剖析和显示模块。可以剖析和显示蛋白质、蛋白质与配体复合物的分子动力学轨迹文件，包含对轨迹进行主成分剖析，计算径向分布函数等。可以将蛋白质、蛋白质-配体复合物的轨迹文件以动态、曲线图和表格的方法表现出来。Analysis模块可以帮助用户地理解酶催化机制、受体激活与细胞信号转导过程中分子构象与能量间的相互影响。在研究受体-配体相互用途时，可以对分子对接的结果进行迅速聚类剖析。

打开后没protocols面板？

打开DS 可能发现protocols面板没，右下角显示的Server:none，用浏览器进入 https://localhost:9943/admin/

输入初始用户名和密码：

User name: scitegicadmin

Password: scitegic

在 security > administrators 下新增一个管理员，并设置密码，然后把默认的用户scitegicadmin删除。
启动DS，双击Server:none，输入localhost过一会右下角显示“Server:localhost”安装成功，protocols面板出现。